Лечението на лупус еритематозус и лупус нефрит зависи от активността на заболяването, клиничния и морфологичен вариант на нефрита. Провеждането на биопсия на бъбреците е необходимо, за да се определят характеристиките на морфологичните промени, за да се избере подходяща терапия, както и да се оцени прогнозата на заболяването.