При първичната туберкулоза лезиите обикновено се локализират в лимфните възли, белите дробове, плеврата и понякога в други органи: бъбреци, стави, кости, перитонеум. Зоната на специфично възпаление може да бъде много малка и да остане скрита по време на изследването. При голямо увреждане обикновено се установява при клинични и радиационни изследвания на пациента.