Най-често псевдомембранозен колит се развива под влиянието на продължителна употреба на антибиотици ампицилин, линкомицин, klinda-mitsina, цефалоспорини, най-малко - пеницилин, еритромицин, хлорамфеникол, тетрациклин. Clostridium труден - спорообразуваща Грам-положителни анаеробни бацил, който е в състояние да произвежда два вида екзотоксини токсин А и токсин В. Има четири основни причини за развитието на псевдомембранозен колит, свързан с С труден.