Клиничната диагноза е надеждна само с лобарен пневмония, но шанса за пневмококова етиология на придобита в обществото пневмония, отит, синузит е около 60-80 °. Потвърждаване на диагнозата може да се основава само на резултатите от микробиологични изследвания съответните biosubstrate: ринит - назален секрет (инсулт), с отит, синузит - гноен ексудат, с пневмония - храчки, менингит - цереброспинална течност.