Бактериолог

Бактериологът е специалист в изучаването на бактериите, техните свойства, ролята им в човешките заболявания и методите за лабораторна идентификация и контрол. Тази професия е част от клиничната микробиология и често е тясно свързана със службите за инфекциозни болести, клиничните лаборатории и системите за обществено здраве.

Съвременните бактериолози работят не само с класически методи за култивиране, но и с бързи молекулярни и масспектрометрични технологии, методи за тестване на чувствителност към антибиотици и системи за наблюдение на микробната резистентност. Ролята на специалиста се измества към интегриране на лабораторни данни с клинична информация, за да се вземат информирани решения за лечение и превенция. [1]

Бактериологичната лаборатория предоставя важни данни: потвърждаване на бактериална инфекция, идентифициране на патогена и изследване на чувствителност към антибиотици. Тези данни влияят върху избора на антибактериални схеми на лечение, епидемиологичното наблюдение и мерките за ограничаване на разпространението на резистентни щамове. [2]

В настоящия контекст на глобален растеж на антимикробната резистентност, бактериолозите играят ключова роля в системата на здравеопазването: от бърза проверка на патогена до коригиране на емпиричната терапия и трансфер на данни към национални и международни системи за наблюдение. [3]

Кога да се свържете с бактериолог или бактериологична лаборатория

Посещение в бактериологична лаборатория е препоръчително при съмнение за бактериална инфекция, в случаи на тежки системни инфекции, когато емпиричната антибактериална терапия е неефективна, както и по време на огнища в институции и за целите на наблюдението. В клиничната практика решението за изпращане на проби обикновено се взема от лекуващия лекар, но е необходима и бактериологична консултация за избор на теста и интерпретация на резултатите.

Особено важно е да се предоставят микробиологични проби преди започване на антибиотична терапия, когато е възможно, тъй като предварителната терапия намалява вероятността от изолиране на патогена чрез култура. Ако събирането на проби не е възможно преди терапията, лабораторията трябва да бъде информирана за приеманите лекарства, за да се осигури точно тълкуване на резултатите.

Остро фебрилно заболяване със съмнение за бактериемия, сепсис или инфекция на кръвния поток изисква незабавно събиране на два или повече комплекта кръвни култури, като се използва асептична техника и оптимален кръвен обем; това повишава чувствителността на теста и минимизира фалшиво положителните резултати, дължащи се на замърсяване. [4]

Ако инфекцията е локализирана, е важно да се избере правилната проба: урина за предполагаема инфекция на пикочните пътища, дълбока рана или пункция за гноен процес, храчки за пневмония, секрет от гениталния тракт за генитални симптоми и т.н. Неправилно събраната или неправилно транспортирана проба ще направи лабораторния резултат неинформативен.

Съвременни методи за идентифициране на патогени: от култура до масспектрометрия

Класическият метод на култивиране остава основата на бактериологичната диагностика: инокулация върху селективни и универсални среди, наблюдение на морфологията на колониите, оцветяване по Грам и биохимична идентификация. Тези методи предоставят възможност за получаване на жива култура за по-нататъшно тестване за чувствителност, определяне на вирулентните свойства и епидемиологични изследвания.

От края на 2000-те години насам молекулярните методи, включително полимеразна верижна реакция и различни платформи за бърза PCR идентификация, станаха широко използвани. Молекулярната диагностика е особено ценна, когато е необходима бърза идентификация на патогени и в случаите, когато културата е неинформативна или невъзможна. [5]

MALDI-TOF масспектрометрията трансформира лабораторните процедури: идентифицирането на чисти култури вече отнема минути вместо часове или дни, което ускорява клиничните решения. В случай на положителна култура, идентификацията чрез масспектрометрия позволява по-бърз преход към таргетна терапия. [6]

За цялостна оценка на патогена се използват комбинирани алгоритми: култура плюс бърза идентификация и паралелно или последователно определяне на маркери за резистентност с помощта на молекулярни методи. Този хибриден подход съчетава предимствата на всеки метод: жива култура за тестване на чувствителност и бърза молекулярна информация за ранни клинични решения. [7]

Антибактериална чувствителност, стандарти за интерпретация и ролята на лабораторията в борбата с резистентността

Тестването за антимикробна чувствителност е централна функция на бактериологичната лаборатория; стандартите за интерпретация се определят от международни организации, предимно от Европейския комитет за тестване на антимикробна чувствителност и Института за клинични и лабораторни стандарти. Спазването на техните препоръки осигурява съпоставимост и клинична валидност на резултатите. [8]

Резултатите от тестовете за чувствителност се използват от клиницистите за преминаване от емпирична към таргетна терапия, за оптимизиране на дозата и за избор на антибиотици с най-нисък риск от развитие на по-нататъшна резистентност. Лабораторията също така наблюдава появата на резистентни фенотипове и информира службите за контрол на инфекциите. [9]

Националните и международните системи за наблюдение, като например GLASS и регионалните мрежи на Световната здравна организация, обобщават лабораторни данни, за да оценят тенденциите в разпространението на резистентни щамове и да планират мерки за обществено здраве. Предаването на висококачествени данни от бактериологичните лаборатории е в основата на такива системи. [10]

Качеството на теста зависи от валидирането на метода, участието на лабораторията във външни програми за оценка на качеството и строгите вътрешни протоколи. Това включва контрол на обема и качеството на пробите, калибриране на оборудването и навременно прилагане на актуализирани насоки за интерпретация на клиничните гранични стойности. [11]

Таблици. Кратки обобщени данни за клинициста и лабораторията

Таблица 1. Методи за идентификация: цел и време на получаване на резултата

Метод	Какво дава?	Очаквано време за постигане на резултати
Културна сеитба	Жива култура, възможно е тестване за чувствителност	24-72 часа
Оцветяване по Грам	Бързо определяне на грам-положителни или грам-отрицателни	10-30 минути
PCR и молекулярни панели	Бърза идентификация на специфични патогени и маркери	1-6 часа
МАЛДИ-ТОФ	Бърза идентификация на чиста култура	Минути след изолиране на колонията
Автоматизирани системи (BACTEC)	Откриване на растеж в кръвни култури	Часове до дни в устройството

Таблица 2. Материал за изследване: какво и как да се събира

Подозрение	Оптимален материал	Забележка
Сепсис	2 комплекта кръвни култури, преди започване на антибиотици	Поддържайте обем и асептика. [12]
Инфекция на пикочните пътища	Сутрешна средна струя урина, стерилен контейнер	Спазвайте хигиената на събирането.
Пневмония	Индуцирано отделяне на храчки или бронхоалвеоларен лаваж, когато е показано	Оценете възможността за орофарингеално замърсяване. [13]
Гнойни рани	Дълбока пункция или събиране на материал след почистване	Повърхностните намазки са с малка информация.

Таблица 3. Стандарти и организации, влияещи върху интерпретацията на тестовете

Организация	Роля
EUCAST	Определяне на клинични гранични стойности и насоки в Европа. [14]
CLSI	Международни стандарти за методи и методики за тестване на чувствителност. [15]
СЗО СТЪКЛО	Глобална платформа за наблюдение на антимикробната резистентност. [16]

Таблица 4. Често срещани бактериални патогени и типични проби

Патоген	Типичен пример	Клинично значение
Ешерихия коли	Урина, кръв, рани	Водеща причина за инфекции на пикочните пътища.[17]
Стафилококус ауреус	Кожа, рани, кръв	Може да причини кожни инфекции, остеомиелит, бактериемия.
Стрептококова пневмония	Храчки, кръв	Честа причина за придобита в обществото пневмония.

Таблица 5. Червени флагове и индикации за спешно пренасочване

Знак	Действие
Прогресивна слабост, пареза	Незабавна неврологична оценка и насочване.
Септично състояние с хипотония	Спешна хоспитализация и кръвни култури преди антибиотици.[18]
Подозрение за менингит	Незабавна пункция и спешна лабораторна диагностика

Ролята на бактериолога в общественото здраве, храненето и контрола на качеството на храните

Бактериолозите участват в системите за мониторинг на безопасността на храните, водата и лекарствата: лабораторните изследвания помагат за идентифициране на замърсяване, разследване на огнища и потвърждаване на ефективността на санитарните мерки. Това е важна част от предотвратяването на инфекции, предавани от храни и околната среда.

В епидемиологията, бактериологичната лаборатория осигурява типизиране на щамове и трансфер на данни към национални бази данни, което позволява проследяване на разпространението на вирулентни или резистентни щамове и прилагането на мерки за обществено здраве. Съвременните методи, включително геномното секвениране, подобряват възможностите за наблюдение. [19]

В условията на санитарен контрол в болниците, лабораторията помага за идентифициране на източниците на болнични огнища и наблюдение на ефективността на мерките за предотвратяване на предаването на патогени между пациентите. Бързата идентификация и предаването на резултатите на персонала за контрол на инфекциите намалява разпространението и подобрява прогнозата. [20]

За промишлеността и безопасността на храните, бактериолозите разработват схеми за вземане на проби, методи за тестване и критерии за приемане на продукти. Такива проучвания защитават общественото здраве и помагат на компаниите да спазват регулаторните изисквания. [21]

Практически препоръки за пациенти и клиницисти

Важно е пациентите да знаят: ако има съмнение за системна инфекция, спазването на указанията за вземане на проби и времето спрямо началото на антибиотичната терапия са от решаващо значение за точната диагноза. При планиране на начална антибиотична терапия за тежко състояние е необходимо, когато е възможно, да се вземе проба преди първата доза. [22]

Клиницистите се насърчават да си сътрудничат с бактериологичната лаборатория по време на избора на тестове, интерпретацията на резултатите и, ако е необходимо, избора на допълнителни молекулярни методи. Лабораторията трябва да получи клиничен контекст за точно отчитане и препоръки за терапевтични стратегии. [23]

Ако в лабораторните данни бъдат открити резистентни щамове, трябва да се включат службите за контрол на инфекциите, емпиричната терапия трябва да се коригира и, ако е необходимо, данните трябва да се прехвърлят към регионални системи за наблюдение. Това е съвместна отговорност на клиниката и лабораторията. [24]

И накрая, за да се подобри качеството на диагностиката и да се намалят рисковете от замърсяване, е важно да се спазват стандартите за събиране и транспортиране на проби, да се участва във външни програми за оценка на качеството и редовно да се актуализират алгоритмите в съответствие с промените в стандартите. [25]

Кратки заключения и практически бележки

1. Бактериологичната диагностика остава крайъгълният камък при идентифицирането на бактериални инфекции и избора на подходяща антибактериална терапия. [26]
2. Съвременните лаборатории използват комбинация от методи за култивиране, молекулярни и масспектрометрични методи за бърза и точна идентификация. [27]
3. Тестването за чувствителност трябва да отговаря на международните стандарти и да бъде част от стратегия за борба с антимикробната резистентност. [28]
4. Спазването на указанията за събиране на проби и комуникацията между клинициста и лабораторията повишават клиничната стойност на резултатите. [29]
5. Бактериологичната лаборатория не е чисто изследователско звено; тя е елемент от системата за здравеопазване и обществена безопасност, който влияе върху грижите за отделните пациенти и здравето на населението. [30]