Изследване на кариотипа

Един от методите за цитогенетично изследване, насочено към изучаване на хромозомите, е кариотипирането. Анализът има редица индикации за прилагане, както и няколко вида.

Кариотипът е набор от човешки хромозоми. Той описва всички характеристики на гените: размер, количество, форма. Обикновено геномът се състои от 46 хромозоми, 44 от които са автозомни, т.е. отговорни са за наследствените черти (цвят на косата и очите, форма на ушите и др.). Последната двойка са половите хромозоми, които определят кариотипа: жени 46XX и мъже 46XY.

По време на диагностичния процес се идентифицират всички геномни аномалии:

• Промени в количествения състав.
• Нарушение на структурата.
• Нарушение на качеството.

Кариотипирането обикновено се извършва при новородени, за да се определят генетични аномалии. Анализът е показан и за семейни двойки, които планират бременност. В този случай изследването позволява да се идентифицира несъответствие на гените, което може да доведе до раждането на дете с наследствени патологии.

Видове молекулярно кариотипизиране:

1. Целенасочено

Предписва се за потвърждаване на различни аномалии и синдроми. Позволява да се определят причините за загуба на бременност: замръзнал плод, спонтанен аборт, прекъсване по медицински причини. Определя етиологията на допълнителен набор хромозоми при триплоидия. Анализът се извършва върху микроматрици с 350 хиляди маркера, концентрирани в клинично значими области на хромозомите. Разделителната способност на това изследване е от 1 милион bp.

2. Стандартен

Открива аномалии в генома с клинично значение. Диагностицира микроделеционни синдроми и патологии, свързани с автозомно доминантни заболявания. Определя причините за хромозомни аномалии при недиференцирани синдроми при пациенти с аномалии в развитието, вродени дефекти, забавено психомоторно развитие, аутизъм.

Позволява откриване на хромозомни аномалии в пренаталния период. Методът определя анеуплоидии, патологични микроделеции в плода. Изследването се провежда върху микроматрица със 750 хиляди маркера с висока плътност, които покриват всички значими области на генома. Разделителната способност на стандартния кариотипния анализ е от 200 хиляди bp.

3. Разширен

Позволява да се установят причините за хромозомни аномалии при недиференцирани синдроми при деца. Разкрива патогенни делеции, т.е. изчезване на хромозомни участъци и дупликации – допълнителни копия на гени. Диагностицира участъци със загуба на хетерозиготност, причини за автозомно-рецесивни патологии.

Анализът с разширен хромозомен микрочип се извършва с помощта на микрочип с висока плътност, който съдържа повече от 2,6 милиона отделни маркера с висока плътност. Разделителната способност на това изследване позволява покриване на целия геном и варира от 50 000 bp до 10 000 bp. Това позволява всички секции от генния код да бъдат изследвани с изключителна прецизност, което прави възможно идентифицирането на най-малките структурни аномалии.

Като правило, кариотипният анализ се извършва по предписание на генетик. В зависимост от показанията на лекаря може да се предпише един от горните видове. Стандартното изследване е по-евтино, но се предписва изключително рядко, тъй като не разкрива много хромозомни аномалии. Целенасоченото кариотипизиране е по-скъп анализ, така че се предписва при наличие на клинични признаци на синдроми и други аномалии. Разширената диагностика е най-скъпата и най-информативна, тъй като позволява пълно изследване на всички 23 комплекта хромозоми.

Къде мога да си направя кариотипно изследване?

Анализът на хромозомни микрочипове се извършва по нареждане на генетик. Изследването е насочено към изучаване на генома на пациента и идентифициране на евентуални аномалии в неговата структура.

Хромозомите са ДНК вериги, чийто брой и структура са специфични за всеки вид. Човешкото тяло съдържа 23 двойки хромозоми. Едната двойка определя пола: жените имат 46XX хромозоми, а мъжете 46XY. Останалите гени са автозоми, т.е. несексуални.

Характеристики на кариотипизирането:

• Анализът се извършва веднъж, тъй като хромозомният набор не се променя през целия живот.
• Позволява ви да определите причините за репродуктивни проблеми при съпрузите.
• Диагностицира множество дефекти в развитието при деца.
• Открива генетични аномалии.

Кариотипът се взема в специализирана медицинска лаборатория или генетичен център. Изследването се провежда от квалифициран лекар. Като правило, тестовете са готови в рамките на 1-2 седмици. Резултатите се дешифрират от генетик.

Показания за процедурата изследване на кариотипа

Процедурата за кариотипизиране се предписва на новородени бебета за идентифициране на генетични аномалии и наследствени патологии, както и на мъже и жени на етап планиране на бременността. Съществуват и редица други показания за анализа:

• Мъжко и женско безплодие с неизвестен произход.
• Мъжки инфертилитет: тежка и необструктивна олигозооспермия, тератозооспермия.
• Спонтанно прекъсване на бременността: спонтанен аборт, замръзнал плод, преждевременно раждане.
• Първична аменорея.
• История на ранна неонатална смъртност.
• Деца с хромозомни аномалии.
• Деца с множество вродени малформации.
• Родителите са над 35 години.
• Многократни неуспешни опити за изкуствено осеменяване (IVF).
• Наследствено заболяване при един от бъдещите родители.
• Хормонални нарушения при жените.
• Сперматогенеза с неизвестна етиология.
• Кровни бракове.
• Неблагоприятна екологична среда за живот.
• Дългосрочен контакт с химикали, радиация.
• Вредни навици: тютюнопушене, алкохол, наркотици, наркомания.

Кариотипирането на деца се извършва в следните случаи:

• Вродени малформации.
• Умствена изостаналост.
• Забавено психомоторно развитие.
• Микроаномалии и забавено психо-речево развитие.
• Сексуални аномалии.
• Нарушение или забавяне на половото развитие.
• Забавяне на растежа.
• Прогноза за здравето на детето.

Диагностиката се препоръчва на всички съпрузи на етапа на планиране на бременността. Анализът може да се извърши и по време на бременност, т.е. пренатално хромозомно изследване.

Как изглежда кариотипният тест?

Наборът от характеристики на пълен набор от хромозоми е кариотип. За систематизиране на хромозомните анализи се използва Международната цитогенетична номенклатура, която се основава на диференциално оцветяване на генома за подробно описание на всички участъци от ДНК вериги.

Проучването ни позволява да идентифицираме:

• Тризомия - наличието на трета допълнителна хромозома в двойката.
• Монозомия - липсва една хромозома от двойка.
• Инверсията е обръщане на дадена област от генома.
• Транслокацията е движението на секции.
• Заличаването е загуба на регион.
• Дупликацията е удвояване на фрагмент.

Резултатите от анализа се записват по следната система:

1. Общият брой хромозоми и наборът от полови хромозоми са 46, XX; 46, XY.
2. Посочени са допълнителни и липсващи хромозоми, например 47, XY, + 21; 46, XY -18.
3. Късото рамо на генома се обозначава със символа p, а дългото рамо - с q.
4. Транслокацията е t, а делецията е del, например 46,XX,del(6)(p12.3)

Готовият анализ на кариотипа изглежда така:

• 46, XX – нормална жена.
• 46, XY – нормален мъж.
• 45, X – Синдром на Шерешевски-Търнър.
• 47 XXY – Синдром на Клайнфелтер.
• 47, XXX – тризомия на Х хромозомата.
• 47, XX (XY), + 21 – Синдром на Даун.
• 47, XY (XX), + 18 – Синдром на Едуардс.
• 47, XX (XY), + 13 – синдром на Патау.

Цитогенетичните изследвания разкриват различни аномалии в структурата на ДНК веригите. Анализът диагностицира и предразположеност към много заболявания: ендокринни патологии, хипертония, увреждане на ставите, миокарден инфаркт и други.

[ 1 ], [ 2 ], [ 3 ], [ 4 ]

Подготовка

Анализът на кариотипа използва кръвни клетки, така че е много важно правилно да се подготвите за диагнозата.

Подготовката за хромозомен тест започва 2 седмици преди неговото провеждане и се състои в елиминиране на въздействието на следните фактори върху организма:

• Остри и хронични заболявания.
• Приемане на лекарства.
• Употреба на алкохол и наркотици, тютюнопушене.

За анализ се използват 4 мл венозна кръв. Кръвта се събира на гладно.

[ 5 ], [ 6 ], [ 7 ], [ 8 ], [ 9 ], [ 10 ], [ 11 ]

Техника изследване на кариотипа

Човешкият геном не може да се види с просто око, хромозомите са видими само под микроскоп в определени фази на клетъчното делене. За определяне на кариотипа се използват мононуклеарни левкоцити, кожни фибробласти или клетки от костен мозък. За изследването са подходящи клетки в метафазата на митозата. Биологичната течност се поставя в епруветка с литий и хепарин. Кръвта се култивира в продължение на 72 часа.

След това културата се обогатява със специални вещества, които спират клетъчното делене във фазата, необходима за диагностика. Културата се използва за направата на препарати, които подлежат на изследване. Допълнителна информация за състоянието на генома се получава чрез оцветяването му. Всяка хромозома има набраздена ивица, която е ясно видима след оцветяване.

При класическо хромозомно изследване оцветяването се извършва с различни багрила и техни смеси. Багрилото се свързва по различен начин с отделните части на генома, което прави оцветяването неравномерно. Поради това се образува комплекс от напречни маркировки, които отразяват линейната хетерогенност на хромозомата.

Основни методи за боядисване:

• Q – предоставя високо детайлни изображения. Този метод се нарича оцветяване на Касперсон с хинакрин-иперит с диагностика под флуоресцентен микроскоп. Използва се за анализ на генетичния пол, идентифициране на транслокации между X и Y, Y и автозоми, както и за скрининг за мозаицизъм с Y хромозоми.
• G – модифициран метод на Романовски-Гимза. Има по-висока чувствителност в сравнение с Q. Използва се като стандартен метод за цитогенетичен анализ. Открива малки аберации, маркерни хромозоми.
• R – се използва за откриване на хомоложни G и Q отрицателни региони. Геномът се третира с акридиново оранжево багрило.
• C – анализира центромерни региони на хромозоми с конститутивен хетерохроматин и вариабилна дистална част на Y.
• Т – използва се за анализ на теломерни региони на ДНК вериги.

Оцветените и фиксирани клетки се фотографират под микроскоп. От получения набор от снимки се формира номериран набор от автозомни двойки, т.е. систематизиран кариотип. Изображението на ДНК веригите е ориентирано вертикално, номерирането зависи от размера, като двойката полови хромозоми затваря набора.

Кръвните препарати се анализират под микроскоп в 20-100 метафазни плаки, за да се идентифицират количествени и структурни аберации.

• Количествените аберации са промени в броя на гените. Това се наблюдава при синдрома на Даун, когато има допълнителна 21-ва хромозома.
• Структурните аберации са промени в самите хромозоми. Това може да бъде загуба на част от генома, прехвърляне на една част в друга, завъртане на 180 градуса и др.

Техниката на кариотипизиране е трудоемък процес. Изследването се извършва от висококвалифицирани специалисти. Може да отнеме цял работен ден, за да се диагностицира геномът на един човек.

Кариотипен анализ на съпрузите

При сключване на брак много двойки се сблъскват с проблема със зачеването. Цитогенетичният анализ е показан за решаване на репродуктивни проблеми. Кариотипизирането на съпрузите позволява да се идентифицират аномалии в структурата на генома, които пречат на раждането на деца или нарушават процеса на раждане. Невъзможно е да се промени кариотипът, но благодарение на диагностиката е възможно да се установят истинските причини за безплодие и прекъсване на бременността и да се намерят начини за тяхното решаване.

Анализът на хромозомни микрочипове се извършва за идентифициране на аномалии в структурата и броя на ДНК веригите, които могат да бъдат причина за наследствени заболявания при бъдещото дете или безплодие на съпрузите. Съществуват международни стандарти за провеждане на анализ при бъдещи родители:

• Хромозомни патологии в семейството.
• История на спонтанен аборт.
• Бременната жена е над 35 години.
• Дългосрочни мутагенни ефекти върху организма.

Днес се използват следните методи за кариотипизиране:

1. Анализ на хромозомите в кръвните клетки.

Позволява да се идентифицират случаи на безплодие, когато шансът за зачеване на дете е значително намален или напълно липсва за единия от съпрузите. Прегледът определя и риска от геномна нестабилност. За лечение на отклонения, на пациентите могат да се предписват антиоксиданти и имуномодулатори, които намаляват неуспехите при зачеване.

За изследването се събира венозна кръв. Лимфоцитите се изолират от биологичната течност, стимулират се в епруветка, третират се със специално вещество, оцветяват се и се изследват. Например, при синдрома на Клайнфелтер, който се проявява като мъжко безплодие, кариотипът съдържа допълнителна хромозома 47 XX. Могат да се открият и структурни промени в генома: инверсия, делеция, транслокация.

2. Пренатални изследвания.

Определя хромозомните патологии на плода в ранните етапи на бременността. Такова изследване е необходимо за диагностициране на генетични заболявания или дефекти в развитието, които водят до вътрематочна смърт на плода.

За провеждане на изследването могат да се използват следните методи:

• Неинвазивен – безопасен за майката и плода. Диагнозата се поставя с помощта на ултразвук на детето и подробен биохимичен анализ на кръвта на жената.
• Инвазивни – биопсия на хориона, кордоцентеза, плацентеза, амниоцентеза. За анализ се събират плацентарни или хорионни клетки, околоплодна течност или кръв от пъпна връв. Въпреки високата диагностична точност, инвазивните методи имат повишен риск от усложнения, така че се извършват само по строги медицински показания: фетални патологии, открити по време на ултразвуково изследване, майката е над 35 години, родителите имат хромозомни аномалии, промени в биохимичните маркери на кръвта.

За цитогенетично изследване може да се използва не само кръв, но и еякулат. Този метод се нарича Тунел и позволява да се определи една от най-честите причини за мъжко безплодие, при условие че кариотипът е нормален – фрагментацията на ДНК на сперматозоидите.

Ако при един от съпрузите се открият генни мутации или хромозомни аберации, лекарят обсъжда възможните рискове и вероятността от раждане на дете с аномалии. Тъй като генните патологии са нелечими, съпрузите вземат самостоятелно решение: да използват донорски материал (сперматозоиди, яйцеклетки), да рискуват да раждат или да останат бездетни.

Ако по време на гестационния процес се открият отклонения в генома, както при жената, така и при ембриона, лекарите препоръчват прекъсване на такива бременности. Това се дължи на повишения риск от раждане на бебе със сериозни, а в някои случаи и несъвместими с живота отклонения. Генетик участва в провеждането на тестове и дешифрирането на резултатите от тях.

[ 12 ], [ 13 ], [ 14 ], [ 15 ], [ 16 ]

Кръвен тест за кариотип

Най-често кариотипизирането се извършва чрез анализ на венозна кръв с помощта на клетъчна култура. Въпреки това, за провеждане на цитогенетични изследвания може да се използва и друг биологичен материал:

• Клетки от околоплодната течност.
• Плацента.
• Ембрионални клетки.
• Материал за аборт.
• Костен мозък.

Материалът, който ще бъде взет за диагностика, зависи от причината и целта на анализа. Приблизителен алгоритъм за кръвни изследвания:

• Малък обем течност се поставя в хранителна среда при температура 37˚C за 72 часа.
• Тъй като хромозомите са видими в метафазния етап на клетъчното делене, към биологичната среда се добавя реагент, който спира процеса на делене в необходимата фаза.
• Клетъчната култура се оцветява, фиксира и анализира под микроскоп.

Кръвен анализ за кариотип осигурява високоточно откриване на всякакви аномалии в структурата на ДНК веригите: интрахромозомни и интерхромозомни пренареждания, промени в реда на геномните фрагменти и др. Основната цел на диагностиката е да се идентифицират генетични заболявания.

[ 17 ], [ 18 ], [ 19 ], [ 20 ]

Генетичен анализ за кариотип

Цитогенетичната диагностика, насочена към изучаване на размера, броя и формата на хромозомите, е генетично кариотипизиране. Анализът има следните показания за прилагане:

• Откриване на вродени дефекти.
• Риск от раждане на дете с наследствени патологии.
• Подозирано безплодие.
• Аномалия в спермограмата.
• Спонтанен аборт.
• Изготвяне на план за лечение на определени видове тумори.

Също така, генетичният анализ за кариотип е включен в списъка със задължителни тестове за съпрузи, които планират да имат деца.

Най-често изследването разкрива следните патологии:

1. Анеуплоидията е промяна в броя на хромозомите, която се увеличава или намалява. Дисбалансът води до спонтанни аборти, раждане на бебета с тежки вродени патологии. Мозаичната анеуплоидия причинява синдром на Даун, синдром на Едуардс и други заболявания, които често са несъвместими с живота.
2. Реорганизация на кариотипа – ако промените са балансирани, тогава хромозомният набор не е нарушен, а просто е подреден по различен начин. При небалансирани промени съществува заплаха от генни мутации, което е особено опасно за бъдещите поколения.
3. Транслокацията е необичайна структура на ДНК веригите, т.е. заместване на един фрагмент от генома с друг. В повечето случаи тя се наследява.
4. Разстройството на половата диференциация е изключително рядко хромозомно заболяване, което не винаги се проявява с външни симптоми. Несъответствието с фенотипния пол може да бъде една от причините за безплодие.

Кариотипен анализ се извършва в генетични лаборатории от квалифицирани генетици.

Кариотипният анализ с аберации

Аберациите са нарушения в структурата на хромозомите, причинени от техните разкъсвания и преразпределение със загуба или дублиране на генетичен материал. Кариотипизирането с аберации е изследване, насочено към идентифициране на всякакви промени в структурата на генома.

Видове аберации:

• Количествено – нарушение на броя на хромозомите.
• Структурни – нарушаване на структурата на генома.
• Редовни – намират се в повечето или всички клетки на тялото.
• Нередовни – възникват поради въздействието на различни неблагоприятни фактори върху организма (вируси, радиация, химическо излагане).

Анализът установява кариотипа, неговите характеристики, признаци на въздействие на различни негативни фактори. Хромозомни изследвания с аберации се провеждат в следните случаи:

• Безплодие в брака.
• Спонтанни спонтанни аборти.
• История на мъртво раждане.
• Ранна детска смъртност.
• Замразена бременност.
• Вродени малформации.
• Нарушение на половата диференциация.
• Подозирани хромозомни аномалии.
• Забавено умствено и физическо развитие.
• Преглед преди ин витро, ИКСИ и други репродуктивни процедури.

За разлика от класическото кариотипизиране, този анализ отнема повече време за извършване и е по-скъп.

Анализ на кариотипа при дете

Според медицинската статистика вродените патологии са значителна причина за смърт при малки деца. За своевременно откриване на генетични аномалии и наследствени заболявания, детето се подлага на анализ на кариотипа.

• Най-често децата се диагностицират с тризомия - синдром на Даун. Тази патология се среща при 1 от 750 бебета и се проявява в различни видове отклонения както във физическото, така и в интелектуалното развитие.
• Второто най-често срещано заболяване е синдромът на Клайнфелтер, който се характеризира със забавено полово развитие в юношеска възраст и се среща при 1 на 600 новородени момчета.
• Друга генетична патология, диагностицирана при 1 на 2500 момичета, е синдромът на Шерешевски-Търнър. В детска възраст това заболяване се проявява с повишена пигментация на кожата, подуване на краката, ръцете и пищялите. По време на пубертета липсва менструация, окосмяване под мишниците и по пубиса, а млечните жлези също не са развити.

Кариотипизирането е необходимо не само за бебета с видими аномалии, тъй като позволява да се подозират генетични проблеми и да се започне тяхната корекция. Анализът се извършва в медико-генетичен център. В зависимост от възрастта на детето, кръв може да се вземе от петата или от вена. Ако е необходимо, генетикът може да изиска от родителите да се подложат на анализ на кариотип.

Кариотипният анализ на новородено

Неонаталният скрининг е първото изследване, което се извършва при новородени. Изследването се извършва в родилния дом на 3-4-ия ден от живота, а за недоносени бебета на 7-ия ден. Ранното кариотипизиране позволява идентифициране на генетични аномалии и нарушения в структурата на ДНК, преди да се появят видими патологични симптоми.

Кръв от петата на бебето се използва за ранна диагностика. Цитогенетичното изследване е насочено към идентифициране на такива често срещани патологии сред бебетата като:

• Фенилкетонурията е наследствено заболяване, характеризиращо се с намалена активност или липса на ензима, който разгражда аминокиселината фенилаланин. С напредването си води до нарушения във функцията на мозъка и умствена изостаналост.
• Кистозна фиброза – засяга жлезите, които произвеждат секрети, храносмилателни сокове, пот, слюнка, слуз. Причинява проблеми с белите дробове и стомашно-чревния тракт. Заболяването е наследствено.
• Вроденият хипотиреоидизъм е нарушение на щитовидната жлеза с недостатъчно производство на нейните хормони. Води до забавено физическо и психическо развитие.
• Адреногениталният синдром е патологично състояние, при което надбъбречната кора произвежда недостатъчно количество хормони. Това причинява нарушаване на развитието на гениталиите.
• Галактеземията е патология, при която е нарушена трансформацията на галактозата в глюкоза. Лечението се състои в отказване от млечни продукти. Без навременна диагноза може да причини слепота и смърт.

Ако резултатите от анализа на кариотипа разкрият някакви отклонения или аномалии при новороденото, тогава се провежда набор от допълнителни изследвания за изясняване на диагнозата. Такава ранна диагностика ще позволи своевременно откриване на евентуални проблеми в тялото на детето и започване на тяхното лечение.

[ 21 ], [ 22 ], [ 23 ], [ 24 ], [ 25 ]

Колко време отнема да се направи кариотипно изследване?

Продължителността на хромозомното изследване отнема от 10 до 21 дни. Кога са готови резултатите зависи от вида на анализа, т.е. с аберации или класическо кариотипизиране.

Попълненият анализ на кариотипа съдържа следната информация:

• Брой хромозоми.
• Има ли някакви промени в структурата на хромозомите?
• Има ли някакви нарушения в подреждането на генома?

Резултатите се дешифрират и интерпретират от генетик. Ако се открият някакви аномалии, лекарят предоставя медицински препоръки за по-нататъшна диагностика или указания за лечение.

Нормална работа

Нормалните кариотипове за хората са 46, XX или 46, XY. Като правило, промяната им настъпва в ранните етапи от развитието на организма:

• Най-често нарушението възниква по време на гаметогенезата (предембрионално развитие), когато родителските зародишни клетки произвеждат кариотипа на зиготата. По-нататъшното развитие на такава зигота води до това, че всички клетки на ембриона съдържат анормален геном.
• Разстройството може да възникне в ранните етапи на деленето на зиготата. В този случай ембрионът съдържа няколко клетъчни клона с различни кариотипове. Тоест, развива се мозаицизъм - множество кариотипове на целия организъм и неговите органи.

Промените в генома се проявяват в различни патологии и дефекти. Нека разгледаме често срещаните аномалии на кариотипа:

• 47,XXY; 48,XXXY – Синдром на Клайнфелтер, полисомия на Х хромозомата при мъжете.
• 45X0; 45X0/46XX; 45.X/46.XY; 46,X iso (Xq) – синдром на Шерешевски-Търнър, монозомия на Х хромозомата, мозаицизъм.
• 47,XXX; 48,XXXX; 49,ХХХХХ – полисомия на Х хромозомата, тризомия.
• 47,XX,+18; 47,ХY,+18 – Синдром на Едуардс, тризомия на хромозома 18.
• 46,XX, 5p- – Синдром на Cri du chat, делеция на късото рамо на 5-тата двойка на генома.
• 47,XX,+21; 47,ХY,+21 – Синдром на Даун, тризомия на хромозома 21.
• 47,XX,+13; 47,ХY,+13 – Синдром на Патау, тризомия на хромозома 13.

Цитогенетичните изследвания са насочени към определяне на състоянието на ДНК веригите, идентифициране на дефекти и аномалии. Всяко отклонение от нормалните показатели е причина за цялостно изследване на тялото.

[ 26 ], [ 27 ], [ 28 ], [ 29 ], [ 30 ], [ 31 ], [ 32 ], [ 33 ], [ 34 ]

Устройството за анализ

За дешифриране на кариотипа се използва методът на секвениране. Този метод е разработен през 1970 г. и се основава на определяне на последователността на аминокиселините в ДНК. Устройствата за секвениране използват интерактивни циклични ензимни реакции с последваща обработка и сравнение на получените резултати.

Основните функции на секвенсерите:

• Първично пълно проучване на неизвестни геноми, екзоми, транскриптоми.
• Кариотипизиране.
• Палеогенетика.
• Метагеномика и микробно разнообразие.
• Пресеквениране и картографиране.
• Анализ на ДНК метилиране.
• Анализ на транскриптоми.

В първия етап устройството създава библиотека от произволни ДНК верижни последователности. След това създава PCR ампликони, които се използват като проби. В последния етап се определя първичната структура на всички фрагменти.

Секвенаторите от най-ново поколение са напълно автоматизирани и се използват широко в геномния анализ, като по този начин се минимизира възможността за грешни резултати поради човешка грешка.

Дешифриране на резултатите от анализ на кариотипа

Генетик интерпретира резултатите от цитогенетично изследване. Като правило, анализът е готов след 1-2 седмици и може да изглежда така:

• 46XX(XY), групирани в 22 двойки и 1 двойка полови гени. Геномът е с нормален размер и структура. Не са открити аномалии.
• Геномът е нарушен, открити са повече/по-малко от 46 хромозоми. Формите и размерите на една/няколко хромозоми са анормални. Геномните двойки са нарушени/неправилно групирани.

Що се отнася до патологичните отклонения в кариотипа, се разграничават следните често срещани нарушения:

• Тризомия - допълнителна соматична хромозома. Синдром на Даун, синдром на Едуардс.
• Монозомията е загуба на една хромозома.
• Делеция - липса на геномна област. -46, xx, 5p - Синдром на Cri du chat.
• Транслокацията е преместването на една част от генома в друга.
• Дупликацията е удвояване на фрагмент.
• Инверсията е завъртане на хромозомен фрагмент.

Въз основа на резултатите от анализа на кариотипа, лекарят прави заключение за състоянието на генотипа и степента на генетичен риск. При най-малките промени в структурата на ДНК веригите се предписва набор от допълнителни изследвания. Идентифицираните аберации може да не се проявят по никакъв начин, но увеличават риска от раждане на бебета с генетични аномалии.