Проучване: гените влияят върху противораковата ефикасност на плодовете и фибрите

Скорошно проучване, публикувано в списанието eBioMedicine, идентифицира генетични вариации, които могат да променят връзката между приема на фибри, плодове и зеленчуци и риска от колоректален рак (КРР). Изследователите успешно идентифицираха два значими локуса, които променят връзката между приема на фибри и плодове и риска от КРР.

Коронарният рак (КОР) е един от най-често срещаните видове рак в света, с близо два милиона нови случая и над 900 000 смъртни случая през 2020 г. Съобщава се, че високият прием на плодове, зеленчуци, пълнозърнести храни и диетични фибри намалява риска от КОР. Въпреки че има сериозни доказателства за връзка между риска от КОР и приема на пълнозърнести храни и диетични фибри, доказателствата за връзка между риска от КОР и приема на плодове и зеленчуци остават ограничени.

Предишни проучвания за асоциации в целия геном (GWAS) са идентифицирали поне 200 локуса, свързани с риск от колоректален карцином, обяснявайки до 35% от наследствеността. Въпреки че взаимодействията ген-среда (G × E) могат да обяснят допълнителна наследственост, предишни проучвания с малки извадки и традиционни методи са открили само ограничен брой значими взаимодействия. Нови статистически подходи, като например съвместни тестове и двуетапни методи, които приоритизират еднонуклеотидните полиморфизми (SNP), имат потенциала да подобрят точността на тези анализи.

В анализа са включени до 45 проучвания от три генетични консорциума за колоректален рак, включващи индивиди от европейски произход. Проучванията включват контролни групи случай за кохортните проучвания и контролни групи без рак за контролните проучвания случай. Общо 69 599, 69 734 и 44 890 участници са анализирани съответно за прием на плодове, зеленчуци и фибри. Хранителният прием е оценен с помощта на въпросници за честотата на хранене и хранителни истории, обикновено изразени като порции на ден за плодове и зеленчуци и грамове на ден за общо количество фибри.

Данните бяха хармонизирани и изразени като квартилни стойности по пол и изследване. Освен това, контролът на качеството на генотипизирането включваше проверка за липсващи данни, равновесие на Харди-Вайнберг и несъответствие между половете, последвано от импутиране и филтриране за честота и точност на минорните алели, което доведе до анализ на 7 250 911 SNP.

В сравнение с контролната група, участниците с колоректален рак са били по-възрастни, са имали по-висок индекс на телесна маса и енергиен прием, както и по-висока честота на рискови фактори като фамилна анамнеза за колоректален рак и диабет тип 2. Те също така са консумирали по-малко фибри, плодове и зеленчуци в сравнение с контролната група. Мета-анализите са установили обратна връзка между приема на фибри (относителен риск на квартилно увеличение (OR) = 0,79), плодове (OR = 0,79) и зеленчуци (OR = 0,82) и риска от колоректален рак.

3-DF тестът идентифицира локуса rs4730274 нагоре по веригата от гена SLC26A3, което показва връзка с приема на фибри и взаимодействие с риска от колоректален рак. Стратификацията по генотип показа по-силна обратна връзка между фибрите и колоректалния рак за всяко копие на алела T. Функционалната анотация предполага енхансерна активност в тъканите на дебелото черво, с eQTL за гена DLD.

Локусът rs1620977 близо до гена NEGR1 показва значителна връзка с консумацията на плодове и умерено взаимодействие с риска от колоректален рак. Наблюдавани са силни обратни асоциации с увеличаване на консумацията на плодове за всяко копие на алела G.

Проучването е най-голямото G×E проучване до момента, в което изследователите идентифицираха две взаимодействия между фибрите, приема на плодове и риска от колоректален рак. По-конкретно, rs4730274 близо до гена SLC26A3 предполага значителна връзка между приема на фибри, чревната функция, възпалението и колоректалния рак. Резултатите изискват допълнителни проучвания, за да се изследват клиничните последици и да се потвърдят тези открития в различни популации.