Проучване идентифицира бактерии, свързани с преждевременното раждане

Изследователи от Държавния университет на Северна Каролина са установили, че множество видове Gardnerella, бактерии, понякога свързани с бактериална вагиноза (BV) и преждевременно раждане, могат да съществуват едновременно в един и същ вагинален микробиом. Констатациите, публикувани в списанието mSystems, допринасят за нарастващото разбиране за въздействието на Gardnerella върху човешкото здраве.

Гарднерелата е група анаеробни бактерии, които са често срещани във вагиналния микробиом. Повишените нива на тези бактерии са отличителен белег на бактериална вагиноза и са свързани с повишен риск от преждевременно раждане, но се срещат и при жени без данни за заболяването.

„Опитвахме се да разберем разнообразието в рамките на Gardnerella“, казва Бен Калахан, доцент по здравеопазване на населението и патобиология в Държавния университет на Северна Каролина и съавтор на статията.

„Учените едва наскоро започнаха да изучават отделни видове гарднерела, така че все още не знаем дали различните видове могат да имат различни последици за здравето. Основната ни цел беше да проучим екологията на гарднерелата.“

Уникално предизвикателство при секвенирането на вагиналния микробиом е, че всички проби са съставени предимно от ДНК на гостоприемника, което прави извличането на микробни данни по-скъпо и трудоемко. Първата задача на изследователския екип беше да разработи методология, която да позволи идентифицирането на различни видове Gardnerella от данни за микробиома.

„Инструментите, с които се изучава вагиналният микробиом, третират всички гарднерели като един вид“, каза Хана Берман, постдокторант в Държавния университет на Северна Каролина и водещ автор на статията. „За да извършим тази работа, трябваше да изградим собствена база данни с геноми на гарднерели и да разработим метод за идентифициране на различни видове гарднерели. Надяваме се, че това ще позволи на повече изследователи да изучат разнообразието на гарднерели.“

Изследователският екип е изследвал данни от секвениране от три кохорти: две произволни популации от бременни жени и една популация с анамнеза за преждевременно раждане. Те са анализирали метагеномните последователности на Gardnerella от пробите, за да видят дали има връзка между специфични видове Gardnerella и преждевременното раждане.

Въпреки че не откриха „неопровержимия аргумент“, те направиха две изненадващи открития.

Първо, те идентифицираха потенциален 14-ти вид Gardnerella сред пробите - преди тази работа бяха идентифицирани само 13 вида.

Те също така установиха, че в повечето проби, съдържащи Gardnerella, множество видове Gardnerella съжителстват в един и същ микробиом: в отделни проби са открити между два и всичките 14 известни вида Gardnerella.

„Обикновено, ако даден вид бактерии колонизира дадена среда, очакваме той да изключи близки роднини, които заемат същата екологична ниша и консумират едни и същи ресурси“, казва Калахан. „Често казвам, че с бактериите всичко е възможно, но това все още е необичайно. Видяхме също, че когато общото микробно натоварване е по-високо, гарднерелата съставлява по-голяма част от това натоварване.“

„Продължават да се натрупват доказателства, че гарднерелата е свързана с преждевременното раждане, но подробностите за тази връзка са сложни. В тази работа не открихме нито един вреден вид гарднерела - може би всички те са вредни. Това далеч не е краят на историята.“

Изследователите се надяват да проучат допълнително въпросите, свързани със съвместното съществуване на видовете и състава на микробиома.

„Вагиналният микробиом е недооценен“, казва Калахан. „Например, той често е доминиран от един вид Lactobacillus, който създава среда, изключваща други бактерии. Когато той изчезне, се появява Gardnerella. И така, как взаимодействат тези бактерии?“

„Отговорите на тези въпроси биха могли да доведат до по-ефективно лечение на бактериална вагиноза и начини за прогнозиране и предотвратяване на преждевременно раждане. Тази работа е важна стъпка в този процес.“